Вода в чистом виде может и не вредит бетону, но где же вы в почве чистую воду найдете. В почве всякие вещества есть — кислоты, соли. Вода их растворяет и в результате, ваш фундамент в воде подвергается химической атаке. Бетон разлагается. Поэтому гидроизоляцию делать необходимо.
Изоляция фундамента — тема отдельного обсуждения. Вкратце, лучше всего добавлять в бетон гидроизоляционные добавки, а оклеечная и обмазочная за несколько лет теряют свои свойства.
Также важно, что вода, даже химически нейтральная, пагубно действует на арматуру в фундаменте, если она есть. А еще, по фундаменту вода может подняться вверх, капиллярное всасывание, и выше по стенам, что вообще плохо. Поэтому лучше всего, не делать в воде, а если уж и делать, то обязательно с изоляцией.